W roku 2009 Kowalczyk przeniósł się do Warszawy i przez cztery sezony doskonalił swoje umiejętności w drużynie „Polonia 2011” Warszawa, z którą to zadebiutował na parkietach ekstraklasy. Od 2012 roku występował w klubach z Gdyni (najpierw „Start”, a następnie „Asseco”). W minionych rozgrywkach w drużynie Asseco Gdynia Sebastian rozegrał 35 spotkań, w których zdobywał średnio 8.5 punktu w nieco ponad 21 minut.
Warto dodać, iż Sebastian Kowalczyk oraz Grzegorz Grochowski w przeszłości występowali już w jednej drużynie. Obaj zawodnicy byli reprezentantami Polski w kadrach młodzieżowych. W swoim ostatnim roku rozgrywek jako młodzieżowcy Grzegorz i Sebastian zdobyli w 2013 roku mistrzostwo dywizji B awansując tym samym do rozgrywek dywizji A. Co ciekawe w sztabie szkoleniowym tamtej reprezentacji był między innymi Krzysztof Szablowski.
- To był bardzo fajny czas. Mieliśmy naprawdę silną drużynę, w której oprócz Grzegorza i Sebastiana grali między innymi Mateusz Ponitka, Przemek Karnowski, Tomek Gielo, Michał Michalak czy Filip Matczak. Wygrać mistrzostwo to zawsze super sprawa, nawet jeśli jest to dywizja B – mówi Krzysztof Szablowski.
Metryczka:
Imię i nazwisko: Sebastian Kowalczyk
Data urodzenia: 25-03-1993
Miejsce urodzenia: Polska, Sieradz
Pozycja: rozgrywający
Wzrost: 188 cm
Kariera:
2002-2008: Trójka Sieradz
2008-2009: ŁKS Łódź
2009-2010: AZS Politechnika Warszawska (1LM)
2010-2011: Polonia 2011 Warszawa (1LM)
2011-2012: AZS II Politechnika Warszawska(2 LM)
2011-2012: AZS Politechnika Warszawska (TBL)
2012-2013: Start Gdynia (TBL)
2013-2014: Asseco Gdynia (TBL)
2014-2015 - Asseco Gdynia (TBL)
2015/2016 - Asseco Gdynia (TBL)